13 ve 14'üncü yüzyillar arası Fizan, Kanem İmparatorluğu'nun eline geçti.17'nci yüzyılda Osmanlı İmparatorluğu bölgede hakimiyet kurdu. Osmanlı İmparatoru 2.Abdülhamid döneminde sürgün yeri olarak kullanıldı çünkü Fizan, başkent İstanbul'dan en uzak toprak parçasıydı. Fizan'a bile giderim ve Fizan'a kadar yolun var sözlerinin çıkış sebebi de budur.